В 2003 г. научные исследования в университете выполнялись в 3-х НИИ (ЯФ, ИН, ВН) при ТПУ и структурных подразделениях вуза: научно-исследовательской части университета в составе НИЧ институтов «Кибернетический центр», Геологии и нефтегазового дела, Языковой коммуникации, Электротехнического, 8 факультетов, 6 ПНИЛ («Гидрогеохимическая», «Лекарственных веществ и органической химии», «Горючих ископаемых», «Синтеза полимеров», «Электроники диэлектриков и полупроводников», «Физико-химического определения микропримесей») и 56 НИЛ, 8 научно-исследовательских центров («Спектр», «Том-Аналитика», «Сибирский сертификационный центр», «Сварка», «Золото-платина», «Центр технологий», центра «Экологической оценки мониторинга», «Регионального центра ресурсосбережения» и «Геоцентра»).

Тематический план НИОКР выполнен полностью. Общий объем полученных средств в 2003 году составил 289,5 млн. руб. Объем внебюджетных средств составил 248,8 млн. руб, в том числе 63,5 млн. руб. по зарубежным контрактам.

Объем госбюджетных средств составил 40,7 млн. руб. и увеличился на 30%. Объем госбюджетных НИР возрос за счет активной работы сотрудников университета в грантах и программах различного уровня: межотраслевых НТП Минатома РФ, Минобороны РФ и Минобразования РФ, 6 грантов, полученных ведущими НПК, молодежными грантами Минобразования РФ.

На базе университета работает Томское региональное отделение Академии естественных наук. ТПУ является головной организацией по 2 крупным разделам конкурса грантов («Действие излучений и защита от них» и «Переработка ядерного топлива и удаление отходов») и Региональной головной организацией Минобразования РФ «Энергосбережение» по Западно-Сибирскому региону.

Университет участвует в выполнении 25 научно-технических программ различного уровня, в том числе 20 программ Минобразования РФ, включая 4 межотраслевые программы Минобразования и Минпромнауки, Минатома, Минобороны, Спецстроя России. Сотрудники университета выиграли 7 грантов Президента РФ, 32 гранта Минобразования РФ, 25 грантов РФФИ и РГНФ. На участие в объявленных программах и грантах 2004г. было подано около 200 заявок.

В 2003г. опубликовано 3857 статей и докладов, в том числе 51 монография (1 в США) и 3 учебника. В центральных изданиях опубликовано 735 статей, за рубежом – 370. По результатам Московской международной книжной выставки-ярмарки монография ТПУ «Взаимодействие импульсных пучков заряженных частиц с веществом» была представлена среди 4 монографий в номинации «Научное книгоиздание» на высшую награду. Направлено 114 заявок на объекты промышленной собственности, получено 77 патентов России и 1 лицензия на право использования полезной модели «Многофункциональный измерительный комплекс». Университетом одним из первых получено роялти от реализации лицензионного договора.

На базе университета проведено 37 научно-технических мероприятий, 15 из которых молодежные. С участием зарубежных партнеров проведено 11 конференций, в том числе 2 студентов и аспирантов. Хорошей традицией стало проведение школ молодого ученого в рамках крупных международных и всероссийских конференций. Так, проведена школа молодого ученого в рамках 12 Международной конференции «Радиационная физика и химия (РФХ)». Кроме того, ученые Томского политехнического принимали активное участие в организации таких конференций, как: Международная НПК «Фундаментальные проблемы пьезоэлектрического приборостроения», г. Москва; юбилейной Всероссийской НПК «Теория и практика газоразрядной фотографии», г. Краснодар; в рамках Ассоциации инженерного образования: в Международном симпозиуме «Элитное техническое образование». В 2003 году разработки университета были представлены на 40 выставках, в том числе 19 международных и 5 зарубежных (Германия, Индия, Австрия, Корея, Казахстан). На выставках было представлено 356 экспонатов, получено 20 медалей и 39 дипломов, из них на международных 9 медалей и 10 дипломов.

Анализ международной деятельности университета позволяет отметить следующее, что как и в прошлые годы, практически весь объем средств, полученных за счет международной научной деятельности, приходится на долю контрактов с крупными зарубежными компаниями. Первое место по объему контрактов ТПУ занимает сотрудничество с ведущими экономически развитыми странами: Германией и Великобританией. В 2003 году удалось восстановить сокращавшийся в последние 3 года объем контрактов с Китаем. Самые крупные контракты заключены под руководством проф. Чахлова В.Л. с Великобританией и Германией на разработку и создание компактных ускорителей.

ТПУ является региональной контактной точкой Комиссии Евросоюза по программе ЕС «Технологии информационного общества» на территории Сибири и Дальнего Востока. Эффективным средством укрепления позиций в международном научно-техническом сотрудничестве являются международные лаборатории. В университете созданы и работают 9 лабораторий, партнерами которых являются ведущие фирмы и лаборатории Франции, Германии, США, Японии, Бразилии, Нидерландов и Италии. Международная лаборатория математической физики (н.р. Галажинский А.В., ЕНМФ), выиграла конкурс на проведение совместных научных исследований с сотрудниками Национального института ядерной физики (Италия).

Первоочередной задачей университета было создание системы управления всеми стадиями инновационных процессов и повышение эффективности использования и коммерциализации результатов научных исследований и образовательной деятельности. Эти исследования выполнялись в соответствии с инновационным проектом Минобразования РФ с объемом 100,0 т.р.с привлечением внебюджетных средств в размере 400,0 т.р. и гранта Томской области – 200,0 т.р. Одним из основных направлений инновационной деятельности является привлечение средств по мегапроектам Минобразования и Минпромнауки РФ, ОАО «Юкос», «Томсктрансгаз», ОАО «Российские железные дороги», Областной и городской Администрации, выполняемым МСФ, ЭЛТИ, НИИ ВН, ИТЦ и совместно с институтами СО РАН.

Инновационным центром ТПУ совместно с отделом интеллектуальной собственности выработана стратегия по управлению и эффективному использованию интеллектуальной собственности университета путем ее трансферта и коммерциализации, разработана модель жизненного цикла инновационной продукции, учитывающей особенности ее создания на кафедрах, в исследовательских центрах и научно-исследовательских институтах. Это позволило активизировать участие подразделений университета в различных конкурсах инновационных и инвестиционных проектов и тендерах на выполнение услуг. На отдельных пилотных проектах были отработаны различные схемы и механизмы коммерциализации наиболее продвинутых к рынку разработок. Так разработанные в НИИ ЯФ при ТПУ комплексы для нанесения теплоотражающих покрытий на стекла в настоящее время участвуют в тендере, проводимым ОАО «Красмаш», на получение заказа по поставке стекла и оборудования для нанесения на него покрытий. По разработке в области «изготовления изделий из нанокерамики и нанокомпозитов» осуществляются мероприятия по патентованию за рубежом с целью оптимальной защиты технологий и передаче прав на использование разработки посредством заключения лицензионного договора с иностранными предприятиями и организациями (НИЦ «Спектр»).

Научным управлением при взаимодействии с отделом маркетинга и инновационным центром на примере разработки УЛК «Химия» (каф. ФАХ ХТФ), реализована полная схема трансферта и коммерциализации разработки – от поддержки разработки за счет средств научного управления до передачи ее в производство с привлечением средств внешних инвесторов. Механизм реализации – лицензионное соглашение, зарегистрированное в Роспатенте, обеспечивающее права ТПУ на интеллектуальную собственность и поступление дохода (роялти) от реализации устройств на рынке.